ngs ONCO anti-EGFR

Metoda detekcji: NGS

Kompleksowe rozwiązanie – od DNA do raportu klinicznego

Solidny panel diagnostyczny - regiony hotspot dla wielu genów diagnostycznych

Łatwy do użycia – brak potrzeby wcześniejszego doświadczenia w technikach NGS oraz doświadczenia bioinformatycznegono

Zestaw służy do diagnozowania raka jelita grubego oraz raka płuc z DNA wyizolowanego z FFPE. Zawiera panel wybranych obszarów hot-spotów, w których objawiają się mutacje decydujące o kierunku dalszego leczenia. Najważniejsze są mutacje w genach KRAS, NRAS i BRAF, w przypadku zmutowanych genów pacjent nie odnosi korzyści z leczenia anty-EGFR. Zestaw służy do przygotowania biblioteki próbek do sekwencjonowania na instrumencie Miseq i jest metodą sekwencjonowania amplikonu. Zestaw zawiera bezpłatne oprogramowanie do oceny ERMI. To oprogramowanie jest bardzo przyjazne dla użytkownika i nie wymaga żadnej wiedzy bioinformatycznej.

Próbki DNA przygotowuje się w dwuetapowej amplifikacji PCR. Docelowe regiony hotspot są amplifikowane podczas pierwszej multipleksowej reakcji PCR, a specyficzne dla próbki molekularne kody kreskowe są dodawane w drugiej uniwersalnej amplifikacji PCR. Poszczególne próbki biblioteki są oczyszczane, normalizowane, łączone i sekwencjonowane na platformie Illumina MiSeq®. Dane z sekwencjonowania są przetwarzane i analizowane przez oprogramowanie ERMI, a użytkownik może eksportować raport.

Parametry zestawu diagnostycznego

• Zestawy diagnostyczne do sekwencjonowania nowej generacji na platformie Illumina MiSeq®
• Do 64 próbek na cykl sekwencyjny (przy użyciu chemii v2 300 cykli)
• Panel 8 odpowiednich genów do diagnostyki molekularnej mutacji somatycznych w raku jelita grubego, raku płuc i czerniakach z zastosowaniem terapii przeciwciałem anty-EGFR
• Starannie zaprojektowane primery do przygotowania pojedynczej probówki amplikonu do multipleksowej reakcji PCR zapewniające jednolite pokrycie
• Odpowiedni dla próbek FFPE i DNA wejściowego w ilościach zaledwie 20 ng
• Prosty protokół przygotowania biblioteki z krótkim czasem pracy
• Opracowany we współpracy z ekspertami z Kliniki Onkologii, General University Hospital in Prague
• Bioinformatyczne oprogramowanie zapewnia przyjazną dla użytkownika analizę danych i generuje raport
• 
  

Panel genów w zestawie diagnostycznym ONCO Anti-EGFR: