RNase R, E. coli

Popis

RNáza R je exoribonukleáza (původ E. coli), která vykazuje 3' - 5' exonukleázovou aktivitu a účinně štěpí téměř všechny lineární druhy RNA. Tento enzym neštěpí kruhovou, lariatovou nebo dvouvláknovou RNA s krátkými převisy na 3' konci (méně než sedm nukleotidů). RNáza R je ideálně vhodná pro studium RNA lariat produkovaných tradičním sestřihem, stejně jako cirkRNA, které vznikají back-splicingem. Odstraněním lineárních RNA z buněčných nebo RNA extraktů RNáza R výrazně usnadňuje identifikaci kruhových druhů pomocí sekvenování RNA.

Aplikace

Studie alternativního sestřihu

Studie genové exprese

Produkce cDNA intronu

Intronický screening cDNA knihoven

Izolace meziproduktů a lariat vzniklých při sestřihu

Zdroj
Rekombinantní kmen E. coli nesoucí gen RNAse R z E. coli

Skladovací pufr

50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA, 1% Triton® X-100, 1 mM DTT, 50% glycerol

10x RNase R reakční pufr
0,2 M Tris-HCl (pH 8.0), 1 M KCl, 1 mM MgCl2

Definice jednotky

Jedna jednotka převede 1 μg poly-r (A) na kyselinou rozpustné nukleotidy za 10 minut při 37 °C v 20 mM Tris-HCl (pH 8.0), 100 mM KCl a 0.1 mM MgCl2.

Doporučené podmínky skladování: -20 °C