DNA & RNA Purification Beads

Popis:

Magnetické kuličky pro purifikaci DNA a RNA od americké společnosti BioDynami kombinují patentovanou chemii BioDynami s jedinečnými vlastnostmi SPRI kuliček (Solid Phase Reversible Immobilization). Oproti běžným SPRI kuličkám jsou tyto kuličky navrženy pro maximální účinnost při čištění nukleových kyselin – spolehlivě odstraňují soli, dNTP, enzymy, primery, adaptéry a další nečistoty. Neobsahují RNAzu, takže jsou vhodné nejen pro práci s DNA, ale i pro citlivější RNA, a to bez dalších nákladů.

BioDynami magnetické kuličky jsou optimalizovány pro selektivní vazbu DNA fragmentů o délce od 100 bp a RNA fragmentů o délce od 200 bází, podobně jako jiné SPRI kuličky, například AMPure® XP* a SPRIselect* a lze je použít pro čištění PCR produktů, koncentraci nukleových kyselin a purifikaci NGS knihoven. Výsledkem purifikace je vysoce kvalitní DNA a RNA bez kontaminantů, vhodná pro širokou škálu aplikací.

Kuličky lze také použít pro selekci DNA fragmentů v rozmezí 150 bp až 800 bp změnou poměru objemu kuliček k vzorku a provedením jednostupňové nebo dvoustupňové selekce. Jsou ideální volbou pro přípravu NGS knihoven, protože je lze snadno začlenit do standardního pracovního postupu. Poměr objemu kuliček je totiž podobný jako u protokolů využívajících běžné magnetické kuličky.

Postup: 

Postup purifikace DNA/RNA pomocí magnetických kuliček je znázorněn na obrázku a zahrnuje přidání kuliček do vzorku, kde se DNA/RNA naváže na jejich povrch. Poté se použije magnet k oddělení kuliček s DNA/RNA od nečistot. Kuličky se promyjí, aby se odstranily zbylé nečistoty, a nakonec se čistá DNA/RNA uvolní do nového roztoku pro další použití.

Vazební kapacita: 
Graf níže ukazuje, že vazební kapacita kuliček je podobná pro oba vstupní objemy (50 µl a 80 µl), přibližně 6 µg/µl kuliček. Výsledkem tedy je, že magnetické kuličky mají stabilní a vysokou vazební kapacitu bez ohledu na vstupní objem vzorku.

Vlastnosti:

• Spolehlivá izolace DNA a RNA
• Selektivní vazba DNA fragmentů nad 100 bází
• Efektivní zachycení RNA fragmentů větších než 200 bází
• Možnost eluce v malém objemu bez ztráty výtěžnosti
• Eluční objem od 10 µl
• Ideální pro vzácné, omezené nebo nízkokoncentrační vzorky
• Vhodné pro manuální i automatizované zpracování
• Lepší výtěžnost při nízkém elučním objemu ve srovnání s jinými kuličkami SPRI
• Snižuje náklady o 50 %

Účinnost:

Jak je z grafu patrné, magnetické kuličky vykazují vysokou účinnost při izolaci různých typů nukleových kyselin, přičemž procento obnovené DNA/RNA dosahuje hodnoty více než 80–100 %. Metoda je kompatibilní s genomovou DNA, dvojvláknovou i jednovláknovou DNA a RNA. Tento spolehlivý výkon se vyznačuje nízkou variabilitou, což činí tuto technologii ideální pro aplikace jako jsou NGS knihovny, PCR nebo klonování.

Následující grafy porovnávají míru obnovy při různých objemech elučního roztoku (40 µl, 20 µl, 15 µl a 10 µl) pro dvě různé aplikace: genomovou DNA (levý graf) a NGS knihovnu (pravý graf). Srovnávány jsou dvě technologie magnetických kuliček: BioDynami beads (modré sloupce) a AMPure® XP (žluté sloupce).Závěrem je, že magnetické kuličky BioDynami jsou účinnější při nízkých objemech eluce než  AMPure® XP, což je patrné jak u genomové DNA, tak u NGS knihoven. 

Aplikace:

• Příprava knihovny NGS
• Purifikace PCR fragmentů
• Purifikace DNA a RNA fragmentů
• Molekulární klonování
• Jiné aplikace vyžadující purifikovanou DNA a RNA
  

Velikost balení:
5 ml (kat.č. 40051S)

20 ml (kat.č. 40051M)

100 ml (kat.č. 40051L)

* AMPure® XP a SPRIselect jsou ochranné známky společnosti Beckman Coulter.