GT Detector Paleo

Popis: 

GT Detector Paleo je souprava vyvinutá pro amplifikaci vysoce polymorfních markerů z DNA nízké kvality a degradované DNA. Tato souprava obsahuje 11 STR markerů a gen Amelogenin jako marker pro určení pohlaví. Použité markery patří mezi STR markery z GT Detector a GT Detector Globe optimalizované pro práci se speciálními a obtížnými vzorky DNA.

Multiplexový systém GT Paleo je optimalizován pro amplifikaci 12 markerů ve velikostním rozmezí 100-300 bp v jediné reakci. Tyto lokusy jsou rozlišeny pomocí 5 barviv s využitím technologie fragmentační analýzy. Tato souprava je kompatibilní s platformami ABI 3500/3500xL, ABI 3130/3130xl a SeqStudio pro detekci a analýzu.

GT Paleo Kit je určen pro molekulárně biologické aplikace ve forenzní vědě, identifikaci osob a určování příbuznosti. Souprava byla validována pro DNA nízké kvality, degradovanou (ať už umělé, nebo z reálných vzorků) a pro DNA ze starých kostí.

Vlastnosti:

• Snadno použitelná multiplex PCR – amplifikace 12 markerů v jediné multiplex PCR.
• Obsahuje 11 STR specifických pro autosomální chromozomy a marker Amelogenin pro určení pohlaví.
• Pro náročné forenzní aplikace, kde kvalita DNA není dobrá nebo je vyžadována přímá PCR.
• Optimalizováno pro práci se starou, degradovanou DNA nebo DNA z kostí.
• Lze použít na DNA extrahovanou z krve nebo krve na GT DBC (DNA banking card) nebo ředěné krve pomocí GT BLB (Blood Diluting buffer), GT AFLB a GT CVLB.
• 5-dye fragment analysis s použitím kapilární elektroforézy.
• Kompatibilní s genetickými analyzátory Applied Biosystems 3130/3130xl a 3500/3500xL.

Markery:

Obrázek níže znázorňuje markery obsažené v soupravě GT Detector Paleo, které jsou rozděleny podle použitých barviv (modrá, zelená, žlutá, červená) a jejich velikostního rozsahu. Souprava zahrnuje 11 STR markerů a marker AMXY pro určení pohlaví, optimalizovaných pro analýzu degradované DNA. Ve spodní části je zobrazen standard velikosti GT500, který slouží k přesné fragmentační analýze pomocí kapilární elektroforézy. Tento systém je ideální pro forenzní aplikace a práci se starými nebo obtížnými vzorky DNA.

Umístění chromozonů:

Níže uvedená tabulka ukazuje markery v GT Detector Paleo Kitu. Jsou zobrazeny názvy, použité barvivo, rozsah velikostí a umístění na chromozomu.

Obrázek níže ukazuje chromozomální umístění markerů obsažených v soupravě GT Detector Paleo, včetně markeru AMXY na chromozomech X a Y. Barevné označení jednotlivých markerů odpovídá jejich rozlišení při fragmentační analýze.

Detekční alelický žebříček:

Graf zobrazuje elektroferogramy získané při analýze markerů ze soupravy GT Detector Paleo pomocí kapilární elektroforézy. Každý barevný graf odpovídá specifickému barvivu (modrá, zelená, žlutá, červená) a zobrazuje amplifikované fragmenty DNA v různých velikostních rozsazích. Jasně rozlišitelné píky reprezentují jednotlivé STR markery, což umožňuje přesnou identifikaci a analýzu vzorků DNA nízké kvality.

Kompabilita a použití:

Souprava je kompatibilní s platformami Applied Biosystems™ 3500/3500xL a SeqStudio pro detekci a analýzu. Výkon GT Detector Paleo byl validován na vzorcích starých, degradovaných, kostních a starých kostí.

Soupravu lze použít na DNA extrahovanou z různých zdrojů, jakož i na DNA získanou pomocí vlasových kořínků, kostní DNA nebo přímým vzorkem do PCR (bez extrakce), jako je GT BLB (Blood Lysis Buffer) a filtrační papíry (GT DBC nebo GT DBC Blue).

Obsah kitu:

Souprava obsahuje všechny potřebné reagencie a pufry pro multiplex PCR (Multiplex Primer mix, PCR buffer, GT HSTaq DNA Pol v boxu A). Souprava je také dodávána s GT Detector Paleo Allelic Ladder, GT500 size standard a GTM5 Matrix standard pro kalibraci genetického analyzátoru (box B).

Velikost balení:

50 reakcí (kat.č. GT-12501-50)

100 reakcí (kat.č. GT-12501-100)

1 000 reakcí (kat.č. GT-12501-1K)

Srovnávací graf kitů HID (Human Identification) od společnosti Genetek Biopharma používaných pro genetickou analýzu. Graf ukazuje počet genetických markerů, které jednotlivé kity detekují, rozdělených podle typu markerů.