Popis:
Prokaryotický Argonaut (pAGO) je klíčový protein v obranném systému hostitele, který zprostředkovává interakce s molekulami nukleových kyselin. Jako endonukleáza řízená DNA z hypertermofilního archeonu Pyrococcus furiosus, protein pfAGO cílí na komplementární DNA bez potřeby PAM (protospacer adjacent motif) nebo PFS (protospacer flanking site) v cílové sekvenci, což značně rozšiřuje možnosti aplikací při výběru dostupných cílových DNA sekvencí. Kromě toho, ve srovnání se systémy CRISPR/Cas, pfAGO endonukleáza využívá k aktivaci štěpení cílové DNA gDNA místo gRNA, což je praktičtější pro in vitro použití, protože gDNA je stabilnější, snadněji se syntetizuje a její výroba je levnější než u gRNA. Tyto vlastnosti činí pfAGO silnou programovatelnou DNA endonukleázou řízenou krátkými gDNA, která je efektivní, rychlá a nákladově efektivní pro detekci nukleových kyselin a také pro využití v různorodých platformách syntetické biologie.
Čistota je vyšší než 95 % podle SDS-PAGE a FPLC.
Protein je dodán o koncentraci 250 pmol, 50 µl (5 µM).
Na obrázku 1 lze vidět schémetické znázornění štěpení DNA řízené ssDNA pomocí PfAGO. Výsledky štěpení DNA pomocí PfAGO jsou na obrázku 2.
Aplikace:
Zdroj:
PfAgo gen z Pyrococcus furiosus (NCBI-Protein ID: AAL80661) exprimovaný v E. coli.
Uskladnění:
-20°C
Adaptivní imunitní systém nalezený u prokaryot využívá CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) a proteiny s ním asociované (Cas) ke štěpení cizího genetického materiálu. Cas13d (také CasRx) pocházející z Ruminococcus flavefaciens XPD3002, je vysoce aktivní a krátká (94 kB).
Rychlá a jednoduchá fragmentace
Velikost fragmentů snadno řiditelná délkou inkubace
Ideální pro přípravu NGS knihoven
Systémy CRISPR-Cas jsou výkonné nástroje pro úpravu nukleových kyselin. Nukleáza Cas12a (také označovaná jako Cpf1), patřící do systému CRISPR druhé třídy typu V je kompaktní a účinný enzym, který štěpí cílovou dvouvláknovou DNA za vzniku fragmentů s lepivými konci.
Adaptivní imunitní systém nalezený u prokaryot využívá CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) a proteiny s ním asociované (Cas) ke štěpení cizího genetického materiálu. Cas13d (také CasRx) pocházející z Ruminococcus flavefaciens XPD3002, je vysoce aktivní a krátká (94 kB).
Rychlá a jednoduchá fragmentace
Velikost fragmentů snadno řiditelná délkou inkubace
Ideální pro přípravu NGS knihoven
původ: E. coli nesoucí gen Tn5
náhodná inserce transpozonu do DNA
vyžaduje 19-bp ME sekvenci
Adaptivní imunitní systém nalezený u prokaryot využívá CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) a proteiny s ním asociované (Cas) ke štěpení cizího genetického materiálu. Cas13a (dříve C2c2) je součástí systému typu VI CRISPR-Cas.
Rychlá a jednoduchá fragmentace
Velikost fragmentů snadno řiditelná délkou inkubace
Ideální pro přípravu NGS knihoven
využití gDNA
původ Pyrococcus furiosus
čistota > 95 %
English
Polski
