Rychlá a jednoduchá fragmentace
Velikost fragmentů snadno řiditelná délkou inkubace
Ideální pro přípravu NGS knihoven
Popis:
DNA Fragmentation & A-tailing Enzyme Mix je speciální enzymatická směs určená pro rychlou a jednoduchou přípravu fragmentované DNA s automatickým přidáním A-tailing na 3′-konce v jednom kroku. Ideální volba pro přípravu vzorků pro sekvenování nové generace (NGS), PCR klonování a TA-ligaci.
Enzymatická fragmentace DNA je ve srovnání s mechanickými metodami štěpení DNA velmi jednoduchá a efektivní. Enzymatická fragmentace DNA má několik výhod, mezi které patří snadná manipulace s mnoha vzorky najednou a menší ztráty vzorků. Navíc nevyžaduje drahé investiční náklady na vybavení.
Obrázek níže znázorňuje postup přípravy DNA fragmentů pro NGS: první krok (DNA fragmentace) trvá 1 minutu práce a 30 minut inkubace, druhý krok (purifikace pomocí magnetických kuliček) zabere 2 minuty práce a 6 minut automatizované inkubace. Proces je tedy rychlý a časově úsporný – většinu času lze věnovat jiné práci v laboratoři.
Graf ukazuje, jak rychle a účinně probíhá fragmentace DNA pomocí enzymatického mixu v závislosti na délce inkubace. Různé barvy křivek odpovídají různým inkubačním časům (10, 15, 20 a 25 minut) a výsledné velikosti DNA fragmentů (204–313 bp). Produkt umožňuje přesně a jednoduše řídit velikost výsledných DNA fragmentů – čím delší inkubace, tím kratší fragmenty.
Vlastnosti:
Nukleáza Cas9 naváděná RNA sekvencí katalyzuje štěpení dvouvláknové DNA na cílovém místě.
Adaptivní imunitní systém nalezený u prokaryot využívá CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) a proteiny s ním asociované (Cas) ke štěpení cizího genetického materiálu. Cas13a (dříve C2c2) je součástí systému typu VI CRISPR-Cas.
Adaptivní imunitní systém nalezený u prokaryot využívá CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) a proteiny s ním asociované (Cas) ke štěpení cizího genetického materiálu. Cas13d (také CasRx) pocházející z Ruminococcus flavefaciens XPD3002, je vysoce aktivní a krátká (94 kB).
Adaptivní imunitní systém nalezený u prokaryot využívá CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) a proteiny s ním asociované (Cas) ke štěpení cizího genetického materiálu. Cas13a (dříve C2c2) je součástí systému typu VI CRISPR-Cas.
Rychlá a jednoduchá fragmentace
Velikost fragmentů snadno řiditelná délkou inkubace
Ideální pro přípravu NGS knihoven
Systémy CRISPR-Cas jsou výkonné nástroje pro úpravu nukleových kyselin. Nukleáza Cas12a (také označovaná jako Cpf1), patřící do systému CRISPR druhé třídy typu V je kompaktní a účinný enzym, který štěpí cílovou dvouvláknovou DNA za vzniku fragmentů s lepivými konci.
Rychlá a jednoduchá fragmentace
Velikost fragmentů snadno řiditelná délkou inkubace
Ideální pro přípravu NGS knihoven
původ: E. coli nesoucí gen Tn5
náhodná inserce transpozonu do DNA
vyžaduje 19-bp ME sekvenci
využití gDNA
původ Pyrococcus furiosus
čistota > 95 %
Adaptivní imunitní systém nalezený u prokaryot využívá CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) a proteiny s ním asociované (Cas) ke štěpení cizího genetického materiálu. Cas13d (také CasRx) pocházející z Ruminococcus flavefaciens XPD3002, je vysoce aktivní a krátká (94 kB).
Rychlá a jednoduchá fragmentace
Velikost fragmentů snadno řiditelná délkou inkubace
Ideální pro přípravu NGS knihoven
English
Polski
