PFS 5′-GAAAG-3′
původ Sulfuricurvum sp. PC08-66
čistota > 95 %
Popis:
Cas12a2, typ V CRISPR/Cas nukleáza, štěpí cílovou RNA po rozpoznání cílové RNA komplementární crRNA. Cas12a2 zpracovává své vlastní crRNA. Pro Cas12a2 je požadovaný motiv PFS 5′-GAAAG-3′. Cas12a2 dokáže neselektivně rozkládat jednovláknovou DNA (ssDNA), dvouvláknovou DNA (dsDNA) a jednovláknovou RNA (ssRNA) jako vedlejší aktivitu poté, co detekuje správné navázání RNA řízené crRNA. Tyto vlastnosti umožňují Cas12a2 fungovat jako jednoefektorová nukleáza, která efektivně a citlivě detekuje RNA. SuCas12a2 od Sulfuricurvum sp. PC08-66 je programovatelná nukleáza řízená 42-44 nt crRNA a lze ji použít při detekci RNA a editaci genomu.
Čistota je vyšší než 95 %, jak bylo stanoveno pomocí SDS-PAGE a FPLC.
Aktivita: Pro test štěpení: 20 µl reakce, včetně enzymu SuCas12a2, crRNA, cílové RNA a 1x reakčního pufru, předehřátá na 37 °C po dobu 15 minut. Poté pro test štěpení ssDNA sondou, jak je znázorněno na obr. 1 níže, bylo přidáno 100 nM ssDNA 5'FAM sondy, inkubováno při 37 °C po dobu 30 minut; Pro test štěpení plasmidu, jak je znázorněn na obr. 2 níže, bylo přidáno 7 nM plasmidu pUC19, inkubováno při 37 °C po dobu 25 minut a reakce byla zastavena 1 ul proteinázy K (800 U/ml).
Aplikace:
Zdroj:
Cas12a2 gen ze Sulfuricurvum sp. PC08-66 (SuCas12a2, UniProtKB: A0A0C2W1L1) vyjádřeno v E. coli.
Skaldování:
-20°C
Velikost:
200 pmol, 200 µl (1 µM) (kat.č. Cas12a2-100)
1 nmol, 200 µl (5 µM) (kat.č. Cas12a2-200)
10X Cas12a2 Reaction Buffer 200 µl (kat.č. CAS12A-BUF-100-A2)
10X Cas12a2 Reaction Buffer 1 ml (kat.č. CAS12A-BUF-200-A2)
využití gDNA
původ Pyrococcus furiosus
čistota > 95 %
Systémy CRISPR-Cas jsou výkonné nástroje pro úpravu nukleových kyselin. Nukleáza Cas12a (také označovaná jako Cpf1), patřící do systému CRISPR druhé třídy typu V je kompaktní a účinný enzym, který štěpí cílovou dvouvláknovou DNA za vzniku fragmentů s lepivými konci.
Adaptivní imunitní systém nalezený u prokaryot využívá CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) a proteiny s ním asociované (Cas) ke štěpení cizího genetického materiálu. Cas13a (dříve C2c2) je součástí systému typu VI CRISPR-Cas.
původ: E. coli nesoucí gen Tn5
náhodná inserce transpozonu do DNA
vyžaduje 19-bp ME sekvenci
Nukleáza Cas9 naváděná RNA sekvencí katalyzuje štěpení dvouvláknové DNA na cílovém místě.
Rychlá a jednoduchá fragmentace
Velikost fragmentů snadno řiditelná délkou inkubace
Ideální pro přípravu NGS knihoven
Benzonázovou endonukleázu (původ Serratia marcescens) lze použít k degradaci všech forem DNA a RNA (jednovláknové, dvouvláknové, lineární i cirkulární). Tento enzym tvoří dimer s dvěma dusilfidickými vazbami o molekulové hmotnosti 30 kD nemá proteolytickou aktivitu.
Adaptivní imunitní systém nalezený u prokaryot využívá CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) a proteiny s ním asociované (Cas) ke štěpení cizího genetického materiálu. Cas13d (také CasRx) pocházející z Ruminococcus flavefaciens XPD3002, je vysoce aktivní a krátká (94 kB).
Rychlá a jednoduchá fragmentace
Velikost fragmentů snadno řiditelná délkou inkubace
Ideální pro přípravu NGS knihoven
Adaptivní imunitní systém nalezený u prokaryot využívá CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) a proteiny s ním asociované (Cas) ke štěpení cizího genetického materiálu. Cas13d (také CasRx) pocházející z Ruminococcus flavefaciens XPD3002, je vysoce aktivní a krátká (94 kB).
Rychlá a jednoduchá fragmentace
Velikost fragmentů snadno řiditelná délkou inkubace
Ideální pro přípravu NGS knihoven
PFS 5′-GAAAG-3′
původ Sulfuricurvum sp. PC08-66
čistota > 95 %
English
Polski
