DNA Fragmentation Enzyme

Popis: 

DNA Fragmentation Enzyme je enzymatická směs určená pro rychlou a jednoduchou náhodnou fragmentaci genomové DNA (EDTA-free DNA nebo DNA resuspendovaná v TE pufru) v jednomm kroku. Výsledné fragmenty DNA mají 5′-fosfáty a 3′-hydroxylové skupiny, což je činí ideálními pro následné aplikace v molekulární biologii, zejména pro přípravu knihoven pro sekvenování nové generace (NGS). 

Enzymatická fragmentace DNA je ve srovnání s mechanickými metodami štěpení DNA velmi jednoduchá a efektivní. Enzymatická fragmentace DNA má několik výhod, mezi které patří snadná manipulace s mnoha vzorky najednou a menší ztráty vzorků. Navíc nevyžaduje drahé investiční náklady na vybavení.

Obrázek níže znázorňuje postup přípravy DNA fragmentů pro NGS: první krok (DNA fragmentace) trvá 1 minutu práce a 30 minut inkubace, druhý krok (purifikace pomocí magnetických kuliček) zabere 2 minuty práce a 6 minut automatizované inkubace. Proces je tedy rychlý a časově úsporný – většinu času lze věnovat jiné práci v laboratoři.

Graf ukazuje, jak rychle a účinně probíhá fragmentace DNA pomocí enzymatického mixu v závislosti na délce inkubace. Různé barvy křivek odpovídají různým inkubačním časům (10, 15, 20 a 25 minut) a výsledné velikosti DNA fragmentů (204–313 bp). Produkt umožňuje přesně a jednoduše řídit velikost výsledných DNA fragmentů – čím delší inkubace, tím kratší fragmenty. 

Vlastnosti: 

• Rychlá fragmentace: Efektivní enzymatická fragmentace během 30–45 minut.
• Jednoduchost použití: Pouze 3 minuty práce s pipetou – minimální ruční zásah.
• Flexibilita vzorků: Pracuje s EDTA-free DNA i DNA v TE pufru.
• Bez potřeby drahého zařízení: Nevyžaduje investice do složitých přístrojů jako mechanické štěpení.
• Ideální pro NGS aplikace: Fragmentace vhodná pro knihovny NGS, PCR klonování, TA-ligaci a blunt end ligaci bez detekovatelného sekvenačního biasu.
• Velikost fragmentů lze ovlivnit časem inkubace: Delší inkubace vede k menším fragmentům